北京市工商行政管理局下设办公室、法制处、登记注册处、企业监督管理处（私营个体经济监督管理处）、外商投资企业管理处、市场监督管理处、合同监督管理处、商标监督管理处、广告监督管理处、消费者权益保护处、经济检查处（打击传销办公室）、特殊交易监督管理处、食品安全协调处、食品安全监察处、市场经济秩序综合处、宣传处、计划财务处、人事处等职能处室和机关党委（教育与基层建设处），纪检、监察机构按有关规定派驻。现有市局机关20个处室及执法检查大队，19个区县分局，6个专业分局，172个工商所、站、队，12个直属事业单位以及5个社会团体，共有干部6000余人。

　　随着社会主义市场经济的发展，工商行政管理的任务越来越重。目前，北京市工商行政管理局监管内资企业40万余户，私营企业22万余户，外商投资企业9000余户，外国企业驻京代表机构9000余户，个体工商户近52万户，消费品市场1000余个。

　　近年来，面对新的形势，北京市工商行政管理局解放思想，与时俱进，制定了今后一个时期的工作目标，即："大力推进工商行政管理市场监管模式的改革，构建与首都国际化大都市地位相适应的、专业化、数字化的工商行政管理体系，完成便捷准入、信用监管、专业执法、'数字工商'的基本建设，初步实现市场监管方式和监管手段的现代化，实现首都市场准入秩序、竞争秩序、交易秩序的根本好转。"为实现这一目标，全系统以市场准入、竞争监管、消保维权"三大格局"为核心，以构建准入服务、信用监管、消保网络、快速执法、调度指挥、技术支撑"六大体系"为重点，全面推进工商行政管理工作，努力为首都经济的健康发展做出新贡献。