2004年3月1日，经福建省委编办批准，福建省第一测绘院和福建省第二测绘院合并组建福建省测绘院。成立后的福建省测绘院的主要职责包括： 1:5000 、 1:10000 国家基本比例尺地形图、影像图、数字化产品的测制和基础地理信息数据的采集与更新；用于全省公开服务的航空、航天遥感测绘；国家和省级测绘行政主管部门确定的其他基础测绘项目；承担行政区域界线测绘等其他法定测绘任务。
        福建省测绘院先后承担完成全省1：1万基础测绘、高速公路、泉州、厦门、漳州1：500 基础测绘、福州、厦门房地籍测绘、全省粮油管理信息系统等我省重大测绘项目；先后获得 全国测绘质量表彰单位、福建省建设系统 “ 八五 ” 期间科技进步先进集体等荣誉。
        作为省内最大的专业测绘队伍，福建省测绘院将充分发挥技术设备先进的内外业一体化 优势，不断优化资源结构，提高生产效率和生产质量，扩大数字测绘生产规模，力求快捷准 确地提供优质的测绘产品和服务。省测绘院将通过贯彻ISO9001质量管理体系，坚持以市场为 导向，坚持科学的发展观，扩大产品应用服务面，为用户提供包括城市大比例尺数字化地形 图、地籍测绘、房产测绘、土地利用更新调查、利用卫星遥感技术成图与信息资源调查、地 理信息系统开发、高速公路带状地形图测绘、海洋测绘及其它测绘工程以及3S（GIS、GPS、 RS）和4D（DLG、DRG、DOM、DEM）产品等多品种、多尺度、多用途的不同模式的测绘产品， 为建设海峡西岸经济区，为全省的经济建设和社会发展提供更优质的服务。